Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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