Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Csn1s1P19228 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms