Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DmdP11531 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DmdP11531 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DmdP11531 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DmdP11531 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DmdP11531 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DmdP11531 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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