Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa1P11477 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms