Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CatspereP0DP43 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CatspereP0DP43 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms