Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf1P09925 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf1P09925 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf1P09925 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf1P09925 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf1P09925 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf1P09925 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf1P09925 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf1P09925 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf1P09925 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Surf1P09925 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf1P09925 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf1P09925 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms