Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtaP09225 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtaP09225 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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LtaP09225 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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LtaP09225 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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LtaP09225 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LtaP09225 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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LtaP09225 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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LtaP09225 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LtaP09225 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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