Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TtrP07309 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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TtrP07309 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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