Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa7P02830 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa7P02830 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms