Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01727 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01727 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01727 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01727 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01727 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01727 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01727 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01727 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01727 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01727 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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