Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trdmt1O55055 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trdmt1O55055 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trdmt1O55055 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdmt1O55055 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdmt1O55055 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trdmt1O55055 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trdmt1O55055 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdmt1O55055 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trdmt1O55055 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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