Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Copb2O55029 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms