Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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