Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DffaO54786 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DffaO54786 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DffaO54786 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DffaO54786 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DffaO54786 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DffaO54786 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DffaO54786 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DffaO54786 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DffaO54786 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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DffaO54786 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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DffaO54786 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DffaO54786 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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DffaO54786 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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DffaO54786 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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DffaO54786 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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