Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sdc4O35988 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sdc4O35988 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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