Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psmb10O35955 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms