Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc1a6O35544 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms