Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Kcns1O35173 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Kcns1O35173 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Kcns1O35173 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms