Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pitx3O35160 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms