Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LhbO09108 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms