Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dctn1O08788 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms