Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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