Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20939L7N243 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms