Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2888K7N746 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2888K7N746 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms