Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2056J3QQ02 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms