Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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