Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms