Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21411J3KMS0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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