Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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