Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms