Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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