Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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H2-M1F7CXU4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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