Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Zfp988F6VKC7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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