Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms