Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms