Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms