Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms