Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cfap58B2RW38 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms