Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AU015836B2RUM3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms