Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms