Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf518bB2RRE4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms