Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brpf1B2RRD7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms