Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms