Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms