Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll11A4Q9F4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll11A4Q9F4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll11A4Q9F4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll11A4Q9F4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll11A4Q9F4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll11A4Q9F4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll11A4Q9F4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms