Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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