Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttll9A2APC3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms