Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SetxA2AKX3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms