Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn6A2AJB9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms