Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc163A2AGD7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc163A2AGD7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms